Resumen y agenda

Acerca de este curso

Prerrequisito
  • Familiaridad con los datos tabulares y las hojas de cálculo.

El horario real puede variar ligeramente dependiendo de los temas y ejercicios elegidos por la instructora.

  • Por favor, asegúrese de tener a mano un editor de hojas de cálculo, como LibreOffice, Microsoft Excel o Google Sheets.

  • Instale R, RStudio y los paquetes (consulte más abajo).

R y RStudio

  • R y RStudio se descargan e instalan por separado. R es el entorno de computación estadística subyacente, pero usar R por sí solo no es muy interesante. RStudio es un entorno de desarrollo integrado (IDE) gráfico que hace que el uso de R sea mucho más sencillo e interactivo. Es necesario instalar R antes de instalar RStudio. Tras instalar ambos programas, deberá instalar algunos paquetes específicos de R dentro de RStudio. Siga las instrucciones a continuación según su sistema operativo y, a continuación, siga las instrucciones para instalar los paquetes.

Está utilizando Windows


  • Abra RStudio y haga clic en “Help” > “Check for updates”. Si hay una versión nueva disponible, cierre RStudio y descargue la versión más reciente de RStudio.
  • Para comprobar qué versión de R está utilizando, inicie RStudio; lo primero que aparece en la consola indicará la versión de R que está ejecutando. Alternativamente, puede escribir sessionInfo(), lo que también mostrará qué versión de R está ejecutando. Acceda al sitio web de CRAN y compruebe si hay una versión más reciente disponible. Si es así, descargue e instale la misma. Puede consultar aquí para obtener más información sobre cómo eliminar versiones antiguas de su sistema si así lo desea.
  • Siga los pasos de las instrucciones para todos al final de esta página.
  • Descargue R desde el sitio web de CRAN.
  • Ejecute el archivo .exe que acaba de descargar
  • Vaya a la página de descargas de RStudio
  • En All Installers, seleccione RStudio xxxx.yy.zz-uuu.exe - Windows 10/11 (donde x, y, z y u representan los números de versión)
  • Haga doble clic en el archivo para instalarlo
  • Una vez instalado, abra RStudio para asegurarse de que funcione y de que no aparezcan mensajes de error.
  • Siga los pasos de las instrucciones para todos al final de esta página.

Está utilizando macOS


  • Abra RStudio y haga clic en “Help” > “Check for updates”. Si hay una versión nueva disponible, cierre RStudio y descargue la versión más reciente de RStudio.
  • Para comprobar la versión de R que está utilizando, inicie RStudio; lo primero que aparece en la terminal indicará la versión de R que está ejecutando. Alternativamente, puede escribir sessionInfo(), lo que también mostrará qué versión de R está ejecutando. Acceda al sitio web de CRAN y compruebe si hay una versión más reciente disponible. Si es así, por favor descargue e instale la misma.
  • Siga los pasos de las instrucciones para todos al final de esta página.
  • Descargue R desde el sitio web de CRAN.
  • Seleccione el archivo .pkg para la versión más reciente de R
  • Haga doble clic en el archivo descargado para instalar R
  • También es recomendable instalar XQuartz (necesario para algunos paquetes)
  • Vaya a la página de descargas de RStudio
  • En All Installers, seleccione RStudio xxxx.yy.zz-uuu.dmg - macOS 10.15+ (donde x, y, z y u representan los números de versión)
  • Haga doble clic en el archivo para instalar RStudio
  • Una vez instalado, abra RStudio para asegurarse de que funcione y de que no aparezcan mensajes de error.
  • Siga los pasos de las instrucciones para todos al final de esta página.

Está utilizando Linux


  • Siga las instrucciones de CRAN para su distribución; estas proporcionan información para obtener la versión más reciente de R para las distribuciones comunes. Para la mayoría de las distribuciones, podría utilizar su gestor de paquetes (por ejemplo, para Debian/Ubuntu ejecute sudo apt-get install r-base, y para Fedora sudo yum install R), pero no recomendamos este enfoque ya que las versiones proporcionadas por este suelen estar desactualizadas. En cualquier caso, asegúrese de tener al menos R 4.2.0.
  • Vaya a la página de descargas de RStudio
  • En All Installers, seleccione la versión que coincida con su distribución e instálela con el método de su preferencia (por ejemplo, con Debian/Ubuntu sudo dpkg -i rstudio-xxxx.yy.zz-uuu-amd64.deb en la terminal).
  • Una vez instalado, abra RStudio para asegurarse de que funcione y de que no aparezcan mensajes de error.
  • Siga los pasos de las instrucciones para todos

Para todos

Tras instalar R y RStudio, deberá instalar un par de paquetes que se utilizarán durante el taller. También aprenderemos sobre la instalación de paquetes a lo largo del curso para explicar los siguientes comandos. Por ahora, simplemente siga las instrucciones a continuación:

  • Inicie RStudio haciendo doble clic en el icono y luego escriba:

R 

install.packages(c("BiocManager", "remotes"))
BiocManager::install(c("tidyverse", "SummarizedExperiment", "hexbin",
                       "patchwork", "gridExtra", "lubridate"))