イントロダクションとセットアップ

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Bioconductorの概要

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Figure 1

Image 1 of 1: ‘Major Bioconductor milestonesと技術の進歩のタイムライン。’

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Figure 2

Image 1 of 1: ‘選択されたBioconductorおよびRのバージョンのリリース日タイムライン。’

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Figure 3

Image 1 of 1: ‘シーケンシングエコシステム。’

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Bioconductor パッケージのインストール

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Figure 1

Image 1 of 1: ‘BiocManager パッケージは CRAN リポジトリから利用可能で、Bioconductor リポジトリからパッケージをインストールするために使用されます。’

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Figure 2

Image 1 of 1: ‘選択された Bioconductor と R のバージョンのリリース日程。’

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ヘルプを取得する

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Image 1 of 1: ‘Bioconductorサポートサイト。’

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BioconductorにおけるS4クラス

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Figure 1

Image 1 of 1: ‘S4クラス、ジェネリックおよびメソッド。’

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Figure 2

Image 1 of 1: ‘メタデータ列。’

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Figure 3

Image 1 of 1: ‘実行長エンコーディング。’

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生物学的配列の取り扱い

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Genomics ranges の取り扱い

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Image 1 of 1: ‘GenomicRanges代数の使用例。’

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Figure 2

Image 1 of 1: ‘区間の例。’

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Figure 3

Image 1 of 1: ‘ゲノム区間の例。’

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アノテーションの取り扱い

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SummarizedExperimentクラス

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Figure 1

Image 1 of 1: ‘SummarizedExperimentクラスの模式図です。’

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